Die von der Firma Peternell aus Seligenthal in Thüringen 1875 ursprünglich errichtete Orgel wurde 1966 abgerissen. Die Empore wurde dabei um einen Meter tiefer gesetzt, um die neue Orgel klanglich besser zur Geltung zu bringen. So hat das Innere der Kirche nach Westen seitdem ein neues Bild, geprägt durch die reich gegliederte Schauseite der Orgel mit den bis zu 5 m hohen Prospektpfeifen der Pedaltürme. Die 1967 eingeweihte Orgel verfügt über 40 Register, verteilt auf drei Manuale und ein Pedal. Sie wurde von der Firma Hillebrand in Altwarmbüchen bei Hannover gebaut und ist in ihrer Bauweise der norddeutschen Orgeltradition verpflichtet.
Im Jahre 1997 wurde die Orgel durch die Firma Alfred Führer, Wilhelmshaven, erstmals klanglich überarbeitet und mit einigen neuen Registern versehen. 2017 erfolgte eine weitere umfassende Reinigung sowie technische und klangliche Generalüberholung durch Heiko Lorenz (Wilhelmshaven).
Für kirchenmusikalische Aufführungen steht außerdem eine Truhenorgel mit 5 Registern und Transponiervorrichtung, erbaut 1998 von der Firma Klop, Garderen / Holland, zur Verfügung.